A COPA possui três secretarias cujas respectivas sedes ficam no Congresso da União do México, na Câmara dos Deputados do Brasil e na Assembléia Nacional de Québec.
A secretaria do Québec atua como secretaria executiva da organização.
As tarefas da organização estão distribuídas entre as três secretarias. Cada secretaria tem a responsabilidade de desenvolver e manter as relações com um determinado número de assembléias parlamentares do continente.
© Assembléia Nacional de Quebec